立法院今年1月陸續三讀通過《政黨及其附隨組織不當取得財產處理條例》、《立法院組織法》及《衛星廣播電視法》部分條文修正案，外界認為分別涉及「救國團解套」、「助理費補助」及被稱為「中天條款」的換照爭議。行政院今（4）日表示，相關修法嚴重背離憲法原則並無視既有司法判決，行政院長卓榮泰已決定行使憲法賦予的副署權，不予副署；不過藍白陣營強烈反彈，質疑行政權逾越憲政分際。
行政院發言人李慧芝指出，《黨產條例》修法將救國團排除適用，並溯及自民國105年8月10日施行，形同推翻司法院大法官既有合憲解釋，疑為特定個案解套，恐動搖司法與法治基礎。
至於外界稱為「中天條款」的《衛星廣播電視法》修正，重點在於新聞台換照申請原則上應准予通過，且若主管機關駁回換照，業者在行政訴訟終結前仍可依原執照於原頻道營運。李慧芝表示，此舉未考量頻位資源稀缺性，對新聞頻道形成不合理差別待遇，恐侵害系統業者與其他頻道的營業自由，也影響民眾通訊傳播自由，並涉及違反權力分立、信賴保護、誠實信用及平等原則。
在《立法院組織法》部分，修法明定立法院應每年以公務預算編列立委辦公事務費、公費助理工資及相關加給。行政院認為，此舉可能讓現行刑法制裁體系出現漏洞，使未來詐領助理費更難以貪污罪追究；且修法過程未符公開透明與充分討論原則，也未具體說明新增財政支出的財源，恐違反法治國與民主原則。
行政院強調，尊重立法院職權，但當修法內容嚴重悖離憲政秩序與民主原則時，行政院有責任把關，此次不副署是為守護憲政制度與人民權利。
面對行政院的大動作，在野黨隨即強烈反擊。國民黨團書記長林沛祥表示，行政院長依法負有副署與公布法律的憲政義務，若因政治立場或個人好惡拒絕副署，形同主動違法並屬選擇性執法，恐動搖行政權受法律拘束的根本原則。
林沛祥認為，若今天可因「不同意」而不副署，未來是否也能因「不喜歡」而不執行，將對憲政秩序造成長遠衝擊。
林沛祥也提及，總統府秘書長潘孟安過去曾表示總統不會不公布法律、行政院也不會不副署，直指卓榮泰此舉形同「打臉」總統賴清德與潘孟安，呼籲行政院懸崖勒馬。
民眾黨立法院黨團總召陳清龍則批評，若總統與行政院因「不高興」即可不公布、不副署立法院三讀通過的法律，等同讓行政權獨大，不僅架空立法權，更形同取代司法權，直指台灣民主法治正遭「毀憲亂政」侵蝕。
陳清龍並質疑，賴清德先前才呼籲朝野和諧，如今卻對三讀法案採取不副署作法，朝野互信恐再受衝擊；他要求賴清德應兌現競選承諾，親赴立法院進行國情報告，說明拒絕公布法律的憲政依據。
卓榮泰去年12月曾首度對《財劃法》修正案不予副署，今年2月亦對《眷改條例》修正案採取相同作法。此次再度動用不副署權，已引發新一波憲政攻防。
